マイクロバイオームとは？

マイクロバイオームとは、特定の環境や生物体内に生息する細菌・ウイルス・真菌・古細菌などの微生物群全体と、それらが保有するすべての遺伝情報（ゲノム）をまとめて指す概念です。単に微生物の集合を表す「マイクロビオータ（microbiota）」と区別して用いる場合もありますが、今日では両語が混用されることも多くなっています。

ヒトの腸内マイクロバイオームは特によく研究されており、腸内には数百種類、総数にして数十兆個ともいわれる微生物が共生しています。これらは食物の消化・吸収を助けるだけでなく、免疫系の調節、神経系への影響、さらにはメンタルヘルスとの関連も示唆されています。腸と脳の双方向コミュニケーション経路は「腸脳軸」と呼ばれ、活発に研究が進んでいます。

マイクロバイオームの乱れ（ディスバイオシス）は、肥満・糖尿病・炎症性腸疾患・アレルギーなど多様な疾患と関係があると考えられています。研究手法としては、次世代シーケンサーを用いたメタゲノム解析が主流で、培養が難しい微生物も一括して同定できるようになりました。

腸内以外にも、皮膚・口腔・肺・土壌・海洋など、あらゆる場所にマイクロバイオームが存在します。プロバイオティクスや食生活の改善によってマイクロバイオームを整えることが健康維持につながるとの知見が蓄積されており、医療・農業・環境科学など幅広い分野での応用が期待されています。